On ne verra pas beaucoup la Base Lunaire dans la série, mais on en entendra beaucoup parler. Cette base militaire appartient à l'Alliance Terrienne et c'est une de ses bases les plus puissantes qu'elle possède. C'est d'ailleurs la Base Lunaire, aussi appelée le Cratère de Ptolémée, que veut rejoindre l'Archangel après l'attaque sur la colonie d'Heliopolis.
La Base Lunaire possède sa propre Flotte et ses propres commandements, elle sert d'intermédiaire entre la Terre et l'Espace. On retrouve aux côtés de cette Base, Copernicus City, la première ville construite sur la Lune. C'est ici que ce sont connus Asran et Kira.